Existem ajustes no microscópio que são personalizados para cada usuário, ou seja, precisam ser reajustados sempre que um usuário diferente esteja utilizando o equipamento. Esses ajustes são o Interpupilar e a Dioptria. Microscópios monoculares não possuem esses ajustes.
Interpupilar: ajusta a distância entre as oculares para a mesma distância entre os olhos do usuário.
O ajuste deve ser realizado utilizando as duas mãos e enquanto se observa a amostra. Deve ser realizado de forma que a imagem visualizada por ambos os olhos seja apenas uma.
Dioptria: tem o objetivo de ajustar a diferença de visão que o usuário possa ter entre os olhos.
Para ajustá-la devemos fechar o olho do lado que está o ajuste de dioptria e focalizar a amostra através do macrométrico e micrométrico do microscópio, feito isso, agora fechamos o olho que estava aberto e abrimos o outro, ajuste o foco novamente movimentando apenas o ajuste da dioptria.
